下記の31項目のてんかん症候群に該当する患者様が登録されます（希少てんかん以外の症候群も含みます）。
これらの疾患の詳細については、「希少てんかんの診療指標」（日本てんかん学会編、診断と治療社、2017年）をご参照ください。
| 1 | 早期ミオクロニー脳症 |
|---|---|
| 2 | 大田原症候群（サプレッション・バーストを伴う早期乳児てんかん性脳症: EIEE） |
| 3 | 遊走性焦点発作を伴う乳児てんかん |
| 4 | West 症候群（点頭てんかん） |
| 5 | Dravet 症候群（乳児重症ミオクロニーてんかん: SMEI） |
| 6 | 非進行性疾患のミオクロニー脳症 |
| 7 | ミオクロニー脱力発作を伴うてんかん（Doose 症候群） |
| 8 | ミオクロニー欠神てんかん |
| 9 | Lennox-Gastaut 症候群 |
| 10 | 徐波睡眠期持続性棘徐波を示すてんかん性脳症（CSWS, ESES） |
| 11 | Landau-Kleffner 症候群 |
| 12 | 進行性ミオクローヌスてんかん（PME） |
| 13 | 海馬硬化症を伴う内側側頭葉てんかん |
| 14 | Rasmussen症候群 |
| 15 | 笑い発作を伴う視床下部過誤腫 |
| 16 | 片側けいれん･片麻痺･てんかん症候群（HHE） |
| 17 | Aicardi症候群 |
| 18 | Angelman症候群 |
| 19 | Rett 症候群 |
| 20 | PCDH19関連症候群 |
| 21 | 環状20番染色体症候群 |
| 22 | 特発性全般てんかん症候群 |
| 23 | 家族性てんかん症候群 |
| 24 | 自然終息性（良性）小児てんかん |
| 25 | 反射てんかん症候群 |
| 26 | Jeavons症候群 |
| 27 | 新生児てんかん |
| 28 | 高齢（初発）てんかん |
| 29 | その他の部分てんかん |
| 30 | その他の全般てんかん |
| 31 | その他の未決定てんかん |
